Il Presidente, eletto dal Consiglio di Amministrazione, è il rappresentante legale della Società. Nel quadro delle strategie definite dal Comitato di Indirizzo, ha compiti di indirizzo e di coordinamento della struttura della Società per il conseguimento degli obiettivi aziendali e sovrintende all’attività del Direttore Generale.

La funzione RSGS - Esercizio ferroviario LN-LI (Responsabile del Sistema di Gestione della Sicurezza dell’Esercizio ferroviario Linea Nazionale e Linea Isolata) riporta gerarchicamente al Vertice societario e ha la responsabilità della sicurezza della linea ferroviaria Trento-Bassano e della linea ferroviaria Trento-Malè-Mezzana.

Il Servizio Affari Generali e Controlli Interni verifica la conformità dell’azienda agli obblighi di Legge, supporta il Responsabile della prevenzione della corruzione e della trasparenza (RPCT), l’Organismo di Vigilanza (OdV) nell’attuazione degli adempimenti previsti dalla normativa in materia, assolve anche la funzione Privacy e riporta al Vertice societario.

Il Direttore Generale sovraintende e dirige tutta l'attività aziendale, sia sotto il profilo produttivo che amministrativo in ottemperanza alle delibere del Consiglio di Amministrazione ed alle direttive del Presidente.

Il modello organizzativo di Trentino trasporti S.p.A. prevede una figura manageriale di Direttore Generale e una di Direttore Tecnico a cui riportano gerarchicamente tutte le unità organizzative di staff e di line.

Funzioni in staff alla Direzione Generale

Le competenze delle funzioni in staff alla Direzione Generale riguardano:

• Assistenza alla Direzione: supporta la Direzione nella gestione di tutte le pratiche di competenza
• SQA (Sicurezza, Qualità e sist.integrato): funzione unica presidiata da due professionalità verticali (sicurezza e qualità) che collaborano per creare un Sistema di Gestione Integrato;
• Comunicazione: comunicazione della società;
• ICT: gestione delle architetture ed infrastrutture ICT (software, hardware) aziendali;
• Servizio tariffe e titoli di viaggio: gestione di tutto il sistema tariffario;
• Amministrazione: gestione della contabilità aziendale e redazione del bilancio di esercizio;
• Finanza: gestione del piano degli investimenti e relativi aspetti finanziari, pagamenti e definizione del fabbisogno di cassa da richiedere alla Provincia Autonoma di Trento sia della gestione ordinaria che straordinaria;
• Controllo di gestione: redazione del budget, complessivo e per servizio, e definizione di report e indicatori di performance;
• Acquisti: l’attività è suddivisa su due caselle, una focalizzata sui "lavori" e una sull'acquisto di "beni e servizi". Il servizio Acquisti Lavori svolge anche attività legale;
• Security: gestione sicurezza anticrimine per prevenzione e protezione da atti criminosi ed accidentali in difesa dei beni aziendali;
• Sinistri: gestione sinistri aziendali.

Il Dirigente Personale e Organizzazione ha funzioni di sviluppo dell’insieme delle politiche, delle pratiche e dei sistemi per la gestione dei comportamenti e delle prestazioni del personale, del capitale umano in modo efficace ed efficiente per influire positivamente sulle performance dell’intera organizzazione, sia in termini di stabilità che di produttività. Garantisce l'indirizzo, il controllo e il coordinamento delle funzioni:

• Servizio Risorse Umane che si occupa di assunzioni, trasferimenti e cessazioni, visite mediche in ingresso, periodiche e di idoneità, anticipi TFR, formazione, contestazioni e richiami
• Servizio Payroll che si occupa di time management ed elaborazione cedolini 

Il Direttore Tecnico ha funzioni di definizione degli obiettivi per le funzioni tecniche in coerenza con le strategie aziendali, indirizzo strategico, coordinamento e controllo delle funzioni tecniche e a supporto del vertice societario. Garantisce l'indirizzo, il controllo e il coordinamento delle funzioni:

Line tecniche

• Trasporto ferroviario
• Servizi automobilisti e funiviari
• Esercizio aeroporto Caproni
• Manutenzione materiale rotabile Gomma
• Infrastruttura e Patrimonio

Funzioni in staff alla Direzione Tecnica

• Segreteria tecnica
• Project manager opere strategiche
• Ingegneria Esercizio
• MITT
• Ambiente e Energia
• Pianificazione, Innovazione e Sviluppo